Uzturlīdzekļu garantiju fonda administrācijas darbu vada un organizē Fonda administrācijas direktors. Direktors nodrošina Fonda administrācijas darbības nepārtrauktību, kā arī nosaka darbinieku kompetenci un atbildību. Fonda administrācijas direktoru ieceļ amatā un atbrīvo no tā Bērnu un ģimenes lietu ministrs.

Fonda administrācijas direktors pieņem lēmumus par uzturlīdzekļu izmaksāšanu, izmaksas pārtraukšanu un izbeigšanu, kā arī pieņem lēmumu un izdod izpildrīkojumu par Fonda administrācijas nepamatoti izmaksāto uzturlīdzekļu piedziņu no iesniedzēja, ja viņš, lai saņemtu uzturlīdzekļus, sniedzis nepatiesas ziņas. Fonda administrācijas direktors atbild par Fonda administrācijas uzdevumu izpildi, Fonda līdzekļu lietderīgu izmantošanu, kā arī atbild par Fonda administrācijas darbības tiesiskumu.

Uzturlīdzekļu garantiju fonda administrācijas direktoram pakļauti:          

Administratīvais departaments
Finanšu departaments
Juridiskais departaments
Lietvedības nodaļa
Sabiedrisko attiecību speciālists
Starptautiskās sadarbības departaments